Мероприятия Добавить мероприятие Спикеры Доклады Коллекции
 

Talk Videos from Bioc 2020

27-31 июля 2020. Онлайн, USA
Смотреть
В избранное
84 Speakers
45 Talks
5 Days
38 Hours of content
Эта страница была создана на основе публично доступных данных без участия организатора конференции.
Если вы представитель Bioconductor, пожалуйста, свяжитесь с нами

О конференции

BioC2020 highlighted current developments within and beyond the Bioconductor project.
Поделиться

Хедлайнеры

Stephanie Hicks

Assistant Professor в Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health
I am an Assistant Professor in the Department of Biostatistics at Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health. I received my B.S. in Mathematics from LSU and my M.A. and Ph.D. from the Department of Statistics at Rice University under the direction of Marek Kimmel and Sharon Plon. I completed my postdoctoral training with Rafael Irizarry in the Department of Biostatistics and Computational Biology at Dana-Farber Cancer Institute and Harvard T.H. Chan School of Public Health. This postdoctoral research resulted in a K99/R00 grant from the ‘National Human Genome Research Institute (NHGRI) to develop statistical methods for the normalization and quantification of single-cell RNA-Sequencing data.

My broad research interests focus around developing statistical methods and tools in application for genomics, epigenomics, functional genomics and most recently, single-cell data. Specifically, my research addresses statistical challenges such as the pre-processing, normalization, analysis of raw, noisy high-throughput data (microarray and next-generation sequencing) leading to an improved quantification and understanding of biological variability.

Federico Marini

Postdoctoral Fellow в IMBEI, University Medical Center Mainz
I am a Postdoctoral Virchow Fellow at the Institute of Medical Biostatistics, Epidemiology and Informatics (IMBEI) and at the Center for Thrombosis and Hemostasis (CTH) in Mainz, Germany.

My research interests involve the development of methods and software for interactive and reproducible research, bringing together the fields of bioinformatics, statistics, genomics, and biology. I can do this thanks to the joint supervision of Prof. Wolfram Ruf and Prof. Miguel Andrade.

Leonardo Collado Torres

Investigator в Lieber Institute for Brain Development
At the Lieber Institute for Brain Development, I am part of the Data Science Team I led by Andrew E Jaffe. My research aims to better understand the roots and signatures of disease (particularly psychiatric disorders) by zooming in across dimensions of gene activity: from studying gene expression at all feature levels (genes to exons to exon-exon junctions and un-annotated regions of expression), to using different gene expression measurement technologies (bulk RNA-seq, single cell/nuclei RNA-seq to spatial transcriptomics) that provide finer biological resolution and localization of gene expression. I'm interested in both hypothesis-driven projects as well as building general resources such as recount2 that enable us to contextualize our findings across all of the public human gene expression landscape. I use the R programming language for nearly all my work and like to organize my code in R packages that I share mostly through the Bioconductor project. From my position at LIBD, I'm able to interact with and collaborate with fantastic biologists, data scientists, researchers at Johns Hopkins University and beyond. Furthermore, I officially help mentor LIBD employees in data science and R tools.
Все докладчики
Смотреть

Лучшие доклады

27.07
28.07
29.07
30.07
31.07
Rafael Irizarry
Chair and Professor в Dana-Farber Cancer Institute
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Rafael Irizarry, Probabilistic Gene Expression Signatures for Single Cell RNA seq Data

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Martin Morgan
Professor в Roswell Park Comprehensive Cancer Center
+ 1 докладчик
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Martin Morgan, Levi Waldron, Opening Remarks edited

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Stefano Mangiola
Professor в Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research
+ 1 докладчик
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Stefano Mangiola, Maria Doyle, Workshop 100: A tidy transcriptomics introduction to RNA Seq analyses

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Haibo Liu
Bioinformatician (Associate Scientist) в Iowa State University
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Haibo Liu, Workshop 200: Best practices for ATAC seq QC and data analysis

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Ludwig Geistlinger
Postdoctoral Fellow в CUNY School of Public Health
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Ludwig Geistlinger, Workshop 200: Functional enrichment analysis of high throughput omics data

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Charlotte Soneson
Research Associate в Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research
+ 3 докладчика
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Charlotte Soneson et al., Workshop 200: Interactive visualization of SummarizedExperiment with iSEE

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Fei Chen
Fellow в Broad Institute
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Fei Chen, Slide seq a platform for understanding cellular circuits in tissue

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Aedin Culhane
Senior Research Scientist в Harvard T.H. Chan School of Public Health
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Aedin Culhane, Workshop 200: An introduction to matrix factorization & principal component analysis

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Marcel Ramos
Senior Data Scientist and Machine Learning Engineer в CUNY Graduate School of Public Health and Health Policy
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Marcel Ramos, Workshop 200: MultiAssayExperiment and curatedTCGAData Bioconductor 2020 workshop

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Michael Love
Statistician в University of North Carolina-Chapel Hill
+ 1 докладчик
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Michael Love, Workshop 200: Importing Alevin Scrna Seq Counts Into R Bioconductor

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
X. Shirley Liu
Professor of Biostatistics and Computational Biology в Dana-Farber Cancer Institute
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

X. Shirley Liu, Computational modeling of protein degradation in tumors

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Kayla Interdonato
Programmer/Analyst в Roswell Park Comprehensive Cancer Center
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Kayla Interdonato, Workshop 500: Material on how to create and submit a package to Bioconductor

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Kelly Street
Research Fellow в Dana-Farber Cancer Institute
+ 2 докладчика
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Kelly Street, Workshop 500: Trajectory inference across conditions: differential expression

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Aaron Lun
Scientist в Genentech
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Aaron Lun, Making the infrastructure sausage tales of Bioconductor package development

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Caroline Uhler
Associate Professor в ETH Zurich
Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно

Caroline Uhler, Multi Domain Data Integration From Observations to Mechanistic Insights

Доступно
В корзине
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
Бесплатно
показать все (45)